二氧化碳培养箱能否抑菌或灭菌是很多用户非常关心的问题，病毒、真菌（霉菌和酵母菌）、细菌、支原体、非同种细胞是二氧化碳培养箱中主要的污染源，培养箱内的环境也同样适合这些污染物的生存，细胞培养中大部分时间里细胞都是位于培养箱内，因此做好抑菌及灭菌的工作是很有必要的。
、污染物介绍：
1.病毒：由于病毒寄生生存，爆发后建议尽快和正常细胞隔离，丢弃处理，相对来说容易处理，尽管病毒污染的细胞不影响原代培养，但生产疫苗是不安全的。因此，潜在病毒是细胞大量生产和疫苗、干扰素等生物制品制作中的难题。
2.真菌（霉菌和酵母菌）：真菌生长的较慢，而细菌却很容易被发现，但旦发现有它的存在说明细胞已被污染了；目前没有好的抑制方法，包括现在常用的两性霉素，旦污染容易反复爆发，尤其孢子很难杀灭。
3.细菌：细菌污染后，培养基1-2天就会变色，对细胞生长影响明显，应迅速将污染细胞与其它细胞系隔离，灭菌后丢弃，还要用实验室消毒剂消毒培养器皿和超净台。
4.支原体：支原体污染后，因它们不会使细胞死亡可以与细胞长期共存，培养基般不发生浑浊，细胞无明显变化，外观上给人以正常感觉，实则细胞已经受到多方面潜在影响，如引起细胞变形，影响DNA合成，抑制细胞生长等，往往被大多数实验者忽视。
5.非同种细胞：即细胞交叉污染，由于细胞培养操作时各细胞株所需的器材和溶液没有严格分开，往往会使种细胞被另种细胞污染。
二、二氧化碳培养箱灭菌技术介绍：
二氧化碳培养箱的灭菌技术目前主要有紫外灯照射、湿热、消毒剂擦拭、干热等。
1.紫外灯照射法的有效性受很多因素影响，如遮挡、时间、强度、照射距离，湿度等。
2.湿热：通常用于高压蒸汽灭菌中，比较少用在CO2培养箱上，湿热灭菌在常压下又叫煮沸法，煮沸的水温般至少需为100℃，细菌繁殖体煮沸5分钟被杀死，但芽胞常需煮沸2小时以上才可被杀死；
3.消毒剂擦拭法：主要适合于平整的表面如实验台面，而箱体内部设计的死角、各种器件因无法擦拭等因素导致灭菌效果也很有限，而且含氯、碘的消毒剂对于不锈钢有腐蚀作用，不能对不锈钢箱体进行擦拭灭菌。
4.高温干热空气灭菌是如今世界公认的有效的灭菌技术，能彻底消灭所有微生物污染源（包括耐高温的芽孢杆菌）。
三、二氧化碳培养箱自身抑菌设计介绍：
1.外体采用优质不锈钢材质，外加抗菌涂层。
2.全圆弧,完全光滑的内胆结构,极大程度上减少了污染面积;易于清洁与保养。
3.内壁采用抛光不锈钢材质，研究显示抛光不锈钢能够明显降低污染物的生长。
4.HEPA高空气过滤器设计，能够有效的过滤掉进气潜在的污染源和颗粒杂质。
防污染设计和消毒灭菌系统污染是导致细胞培养失败的个主要因素，因而，二氧化碳培养箱的制造商们设计了多种不同的装置去减少和防止污染的发生，其主要途径都是在尽量减少微生物可生长的区域和表面，并结合自动排除污染装置来有效防止污染的产生。
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